Class 08: 第8节 - 上海生物信息技术研究中心

Report
医学信息相关标准介绍
张旭峰
上海生物信息技术研究中心
2011.4.19
提纲
1
信息标准化基本概念
2
医学信息表达标准介绍
3
医学信息处理标准介绍
基本概念
信息标准化定义
狭义
指信息表达上的标准化,在一定范围内人们能共同
使用的对某类、某些、某个个体抽象的描述与表
达。
广义
指对整个信息的处理,包括标准化的信息、信息传
递与通讯、数据流程、信息处理技术与方法、信息
处理设备等。
医学信息标准化
信息标准化在医学领域的应用。
基本概念
信息标准分类
信息表达标准化:是信息标准化的基础,如分
类、编码,名称和内涵的标准化、代码化。
信息交换标准化:解决不同系统和部门间信息
共享的问题。
信息处理与流程标准化:主要利于信息系统的
开发和推广。
基本概念
 医学信息的特点
 种类繁多
 面广量大、更新快
 量化困难
 自然语言标准化的困难
 医学信息标准化的基础
 信息的分类和编码
 医学术语和医学专业词汇汇编
 医学信息硬件和软件的标准化
软件产品的标准化
生产和管理软件工程的标准化
软件开发环境的标准化
医学信息表达标准介绍
ICD—国际疾病分类
 (International Classification of
Disease, ICD )是根据疾病的某些特征,按照
规则将疾病分门别类,并用编码的方法来表示
的系统。
 ICD已有110年发展历史:
 1891年第1版;
 1940年第6次修订,首次引入疾病分类,强调按
病因分类的思想;
 1975年ICD-9,得到推广;
 1994年ICD10;
 北京协和医院世界卫生组织疾病分类合作中心
负责有关疾病分类的中文事宜
ICD-10分类原理
 依据疾病的四个主要特性,即病因、部位、
病理和临 床表现 ,形成一个多轴心的分类系
统。
ICD分类的基础是对疾病的命名;
疾病的本质和表现特性正是分类的依据;
 分类与命名之间存在一种内在的对应关系;
 对指定疾病赋予一个编码,编码是唯一的;
ICD分类的方法
采用以病因为主、解剖部位、临床表现、
病理为轴心的基本原则。
前3位编码为ICD-10类目码,如急性阑尾炎 K35
前4位编码为ICD-10亚目码,急性阑尾炎伴腹膜
脓肿 K35.1
第5-6位数为扩展码,5位代码为细目编码,疾
病分类编码应当到6位数,每一个编码代表一个
具体的疾病,例如:原发性单侧髋关节病
M16.101
双重分类:剑号“†”与星号 “*”(病因与临
床表现), 如A18.8†I32.0*
ICD的应用和意义
标准化:使得疾病名称标准化、格式化,这是
医学信息化、医院信息管理的基础,也是电
子 病历等应用基础。
共享性:疾病信息得到最大范围的共享
有利医疗管理:医疗统计的基础,便于了解各
病种的相关信息。
有利费用管理:疾病分类是医疗经费控制的
重 要依据之一,而城镇职工医疗保险制度采
用按病种计费,促使各种病种制定规范化治
疗方案 。
SNOMED-人类与兽医学系统术语
(Systematized nomenclature of human and
veterinary medicine, SNOMED)用于人、兽医
学的结构化术语集和术语的分类。
颁布于1974年。目前是第三版,《人类与兽
类医学系统术语》,也称《国际医学规范术
语全集》。
SNOMED RT
参考术语(reference terminology):多维、多层
次的标准医学术语集,强调临床术语语义
上的一致性。既可以满足用户结构化、智
能化录入临床数据的需要,又能够用于优化
自然语言处理,还能帮助完成医学信息的存
储、提取与分析,把这种更高层次的满足广
泛医学信息处理需求的标准术语集成为参
考术语。
SNOMED CT
 2002年1月,SNOMED RT(SNOMED Reference
Terminology,医学术语系统命名法-参考术语集)
与英国国家卫生服务部(National Health Service,
NHS)的临床术语(Clinical Terms,又称为Read
Codes)相互合并,并经过扩充和结构重组,从而
形成了SNOMED CT。SNOMED RT在历史上的优点就
是它的那些专业医学术语集以及所采用的分布式协
作开发方法,而第3版临床术语(Clinical Terms
Version 3,CTV3)的优势则是它在全科医学方面的
那些术语集。通过把这两个体系组合起来,
SNOMED CT目前成为现有任何语言之中最为广泛全
面的临床词表,收录有超过344,000个概念,涵盖了
临床医学的大多数方面。
SNOMED(中文版)的结构
SNOMED是多轴编码的医学命名法,有若干独
立的编码体系,每一个轴可以用于描述同一
个诊断
全部术语分入11个独立的系统模块(轴)
术语按照自然层次排列,被分配5或6位代码
代码与术语一一对应,标示术语的内在信息
组、上 下关系
通过使用G(链接词/修饰词)模块,可连接和
修饰每个模块术语、描述符及限定词。
词条的索引排列是按照编码顺序
SNOMED的11个轴
轴
定义
说明
T
M
L
C
F
J
D
P
A
S
G
局部解剖
形态学
微生物学
化学制品
功能
职业
诊断
过程
物理因素、力、作业
社会关系
一般状况
解剖术语
细胞、组织、器官
细菌和病毒
药物
体征和症状
描述职业的术语
诊断术语
管理、诊断和治疗过程
与疾病相关的设备和行为
医学上的社会条件和重要关系
语法连接和资格
例子
每一种疾病诊断包含局部解剖学代码、形
态学代码、微生物学代码和功能代码,确
切定义一种诊断需要4种代码复合。如诊断
代码D-13510(链球性肺炎)等价于T-
2800(解剖代码、肺部),M-4000(形态
学代码、炎症),L-25116(微生物学代
码、链球菌)。
SNOMED的应用
将人、兽医学术语进行结构化的分类和编
码,
使得原有的医学术语标准化,为计算机处理
奠 定了基础;
标准化的、规范的应用医学术语将有利于
医学 信息共享和提高医疗质量;
术语代码拥有医学知识表达的许多特征,具
开放式的数据结构,可灵活地进行搭配、组
装、合成,适用于电子病历,并支持专家系统。
UMLS-统一的医学语言系统
美国政府投资,国立卫生研究院和国立医
学图书馆承担。
尝试从各种信息资源中提取和集成电子生
物医学信息。试图跨越病案系统、文献摘
要数据库、全文数据库及专家系统之间的
屏障。
提供了标准和其他数据和知识资源之间的
交叉参照,帮助解决许多医学信息交换中
的难题。
LOINC-观测指标标识符逻辑命名与编码系统
 LOINC数据库旨在促进临床观测指标结果的交换与
共享
 LOINC术语涉及用于临床医疗护理、结局管理和临
床研究等目的的各种临床观测指标。
 LOINC数据库实验室部分所收录的术语涵盖了化
学、血液学、血清学、微生物学(包括寄生虫学和
病毒学)以及毒理学等常见类别或领域;还有与药
物相关的检测指标,以及在全血计数或脑脊髓液细
胞计数中的细胞计数指标等类别的术语。
 LOINC数据库临床部分的术语则包括生命体征、血
液动力学、液体的摄入与排出等多类临床观测指
标。
DRG-诊断相关分类系统
专门用于美国医疗保险预付款制度的分类
编码标准。它根据病人的年龄、性别、住
院天数、临床诊断、病症、手术、疾病严
重程度及转归等因素把病人划分到大约500
个诊断相关组,然后决定给医院多少补偿。
由美国卫生保健财务管理署(HCFA)于
1983年公布。
在医学经济学研究和医疗质量控制方面也
有应用。
HIPPA-医疗电子交换法案
 美国联邦法律。
 强制性标准。迫使美国医疗软件的大修改。
 目的:改善病人、卫生服务部门和医疗保险部
门之间的信息交换,确保信息的可交换性、保
护病人的隐私权和数据的安全可靠。
 HIPPA具体包括:
 电子化的病人医疗、管理和费用信息的标准化;
 适用于个人、单位、健康计划和卫生保健服务供应
部门的唯一的标识符;
 保护个人健康信息的隐私性和完整性的安全标准。
医学信息处理标准介绍
DICOM-医学数字成像和通信标准
在DICOM标准中详细定义了影像及其相关
信息的组成格式和交换方法,利用这个标
准,人们可以在影像设备上建立一个接口
来完成影像数据的输入/输出工作。
DICOM标准以计算机网络的工业化标准为
基础,它能帮助更有效地在医学影像设备
之间传输交换数字影像,这些设备不仅包
括CT、MR、核医学和超声检查,而且还包
括CR、胶片数字化系统、视频采集系统和
HIS/RIS信息管理系统等。
DICOM
DICOM标准中涵盖了医学数字图像的采集、
归档、通信、显示及查询等几乎所有信息
交换的协议;以开放互联的架构和面向对
象的方法定义了一套包含各种类型的医学
诊断图像及其相关的分析、报告等信息的
对象集;定义了用于信息传递、交换的服
务类与命令集,以及消息的标准响应;详
述了唯一标识各类信息对象的技术;提供
了应用干网络环境(OSI或TCP/IP)的服
务支持;结构化地定义了制造厂商的兼容
性声明(Conformance Statement)。
DICOM
ACR(美国放射学会)和NEMA(国家电子
制造商协会)联合组成委员会提出,它从
最初的1.0版本到1988年推出的2.0版本,到
1993年发布的DICOM标准3.0,已发展成为
医学影像信息学领域的国际通用标准。
目前,世界医学影像设备的主要供应商都
宣布支持DICOM标准。无论在提高医疗诊
断水平方面,还是在提高与医学影像及其
信息有关的经济效益方面,DICOM标准的
出现为医疗机构带来全新的机会
HL7
HL7(Health Level Seven)标准主要用于与卫
生保 健计算机系统有关的临床、银行、保
险、管理、行 政及检验等信息的交换。
HL-7是由美国研究开发的一个专门用于医疗
卫 生机构及医用仪器设备数据信息传输的
标准,
是一种标准化的卫生消息传输协议。
HL7组织参考ISO,采用开放式系统互联(Open
system interconnection, OSI)的通信模式,将
HL7 纳入通信最高层,即第七层应用层。
HL7-历史
1987年San Sohultz提出HL7,成立HL7国际组
织,(网站是http://www.hl7.org ) 1994年美国
ANSI承认HL7
1996年、2000年公布了HL7 v2.3和v2.4 2004
年公布HL7 v3.0版
HL7 V3
HL7 V3采用面向对象的建模技术
HL7 V3考虑到信息交换过程中的安全性、
隐私性
HL7 V3采用了多种信息表达技术如XML,
EDIFACT等以增进系统间的互操作性。
HL7-基本概念
HL7规范包括两部分内容
信息模型定义(RIM模型)
信息如何封装、传递(Infrastructure)
HL7-RIM模型
HL7-Message Type定义
HL7-Infrastructure
HL7-消息设计流程
(1)建立用例(use case)模型;
(2)建立RIM;
(3)建立类之间信息交互模型;
(4)消息设计,获得等级消息描述;
(5)消息交换实现技术说明。
CDA-Clinical Document Architecture
是以临床文档交换为目的的,描述临床文
档的结构和语义的文档标记标准。
是HL7标准的一部分
分为head和body两部分
CDA R-MIM
openEHR
 OpenEHR组(Open Electronic Health Record
Foundation,OpenEHR Foundation)是成立于
2003年的非营利组织。综合了英国、澳大利亚
及一些欧洲国家在电子健康档案方面的研究经
验,利用开源组件基于相关标准,设计可交互
操作的电子健康档案,并通过临床示例去验证
和完善。
 OpenEHR的主要目标有:
 修正电子健康档案的规范;
 改进和发布 OpenEHR的信息架构和数据模型 ;
 通过临床实践评价和确立 OpenEHR原型;
 实现互操作。
openEHR-框架
openEHR-框架
openEHR-两层模型
HER领域模型
诊疗流程领域模型
IHE
IHE(Integrating the health enterprise)是工
作流程的标准,解决不同IT系统间的协同工
作问题,其应用将影响到整个医疗卫生行
业,是实现电子病历的关键性工具。
2002~2003年,美国北美放射学会(RSNA)
和美国卫生信息和管理系统协会(HIMSS)
启动该项目,以集成不同的医疗IT系统 。
IHE
目前,IHE主要应用在影像诊断和PACS,但
其方法学和实现技术正在被推广到整个行
业。
支持放射信息管理的IHE规则集(provision)
有14个标准框架(profile)。
IHE
谢谢
[email protected]

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