Stata讲解课件

Report
张 超
湖北医药学院附属太和医院循证医学
Center for Evidence-Based Medicine and Clinical Research
Taihe Hospital, Hubei University of Medicine
目 录
1. Stata软件介绍
2. Stata软件操作
3. Stata软件图形编辑
4. 实例演练
软件介绍
1. Stata软件历史
2. Stata软件产品
3. Meta程序包安装
Stata软件历史
最早于20世纪80年代推出Stata 1.0 ,其基于DOS系
统
2. 目前,最新版本为Stata 13.0,其基于Windows、
Macs及Unix。本次,讲解Stata 12.0 ……
1.
$2,090
3. Stata软件官网:http://www.stata.com
Stata软件产品:
Stata News
Stata Journal
Stata Bookstore
Stata Blog
<<应用STATA做Meta分析>>
…
Meta程序包安装:
1. 安装Meta分析命令文件
2. 加载Meta分析操作控件
安装命令文件:
net from http://www.stata-press.com/data/mais
net install mais
spinst_mais
安装操作控件:
1. 安装窗口文件—dlg文件
ssc install metadialog.pkg
2. 生成自动执行控件生成文件—profile.do
注意:1、profile.do文件存放于Stata软件安装的根目录
文件夹中
2、目前,无法安装诊断性Meta分析控件(.dlg)
诊断性Meta分析代码安装:
1. midas.ado文件下载:
http://sitemaker.umich.edu/metadiagnosi
s/resources
2. metandi.ado文件下载:
http://ideas.repec.org/c/boc/bocode/s456
932.html
3. 上述,两个ado文件全部放入到ado文件夹
中
执行文件关系图
hlp文件
菜单执行
结果
pkg文件
dlg文件
ado
文件
图形
代码执行
dta文件
图形编辑
Stata软件操作
1. 软件界面介绍
2. 数据排列格式
3. 软件菜单式及命令式操作
软件界面简介
菜单栏
快捷菜单栏
命令回顾窗口
结果输出窗口
命令输入窗口
变量显示窗口
变量
属性
窗口
计数资料
数据结构—基于四格表形式:
研究
暴露组
非暴露组
总数
试验组
a
b
a+b
对照组
c
d
c+d
注:a—试验组暴露数,b—试验组非暴露数,a+b—试验组总数
c—对照组暴露数,d—对照组非暴露数,c+d—对照组总数
计数资料
具体数据录入格式:
亚组依据
authors
year
a
b
c
d
latitude
allocation
Aronson
1948
4
119
11
128
44
1
Ferguson & Simes
1949
6
300
29
274
55
1
Rosenthal et al
1960
3
228
11
209
42
1
Hart & Sutherland
1977
62
13536
248
12619
52
1
Frimodt-Moller et al
1973
33
5036
47
5761
13
2
Stein & Aronson
1953
180
1361
372
1079
44
2
Vandiviere et al
1973
8
2537
10
619
19
1
TPT Madras
1980
505
87886
499
87892
13
1
Cpetzee & Berjak
1968
29
7470
45
7232
27
1
Rosenthal et al
1961
17
1699
65
1600
42
3
Comstock et al
1974
186
50448
141
27197
18
3
Comstock & Webster
1969
5
2493
3
2338
33
3
Comstock et al
1976
27
16886
29
17825
33
3
计数资料
Stata软件数据录入:
计数资料
Stata软件运算操作:
1
计数数据
2
3
对应四格表
数据标签
效应量
分亚组
模型,方法
结果
对应命令
采用固定模型,效应量为RR
森林图
采用固定模型,效应量为RR
结果
对应命令
分亚组
采用随机模型—分亚组,效应量为RR
森林图
亚组1
亚组2
亚组3
采用随机模型—分亚组,效应量为RR
漏斗图数据
数据经对数转换代码:gen logrr=log(_ES)
_SS
_ES
_selogES
_LCI
_UCI
_WT
logrr
262
0.410939
0.5706
0.134302
1.257398
5.040297
-0.88931
609
0.204868
0.441114
0.086297
0.486352
6.350208
-1.58539
451
0.25974
0.64449
0.073443
0.918609
4.415995
-1.34807
26465
0.236561
0.141457
0.179281
0.312141
9.714516
-1.44155
10877
0.80449
0.226297
0.516293
1.253558
8.874237
-0.21755
2992
0.455611
0.0831
0.387132
0.536203
10.11686
-0.78612
3174
0.197721
0.472247
0.078357
0.498919
6.011108
-1.6209
176782
1.012024
0.062941
0.894572
1.144897
10.21188
0.011952
14776
0.625366
0.237559
0.392576
0.996196
8.747549
-0.46942
3381
0.253765
0.270231
0.149421
0.430976
8.368153
-1.37134
77972
0.712227
0.11141
0.572514
0.886035
9.943801
-0.33936
4839
1.561916
0.72973
0.373689
6.528374
3.80165
0.445913
34767
0.982835
0.267217
0.582137
1.659341
8.403747
-0.01731
漏斗图绘制所需数据:logrr与_selogES
漏斗图操作
1
2
3
分亚组
对应代码: metafunnel logrr _selogES
漏斗图
Begg或Egger检验法
1
2
3
对应代码: metabias logrr _selogES, graph(begg) 或 graph(egger)
Begg或Egger检验法
Begg检验法漏斗图
Egger检验法回归图
敏感性分析
1
2
3
对应代码: metainf logrr _selogES, random id(authors) eform
敏感性分析
诊断性资料
数据结构—其实质基于四格表形式:
金标准诊断(D)
诊断试验结果(T)
合计
病例(D+)
病例(D-)
阳性(T+)
TP(真阳性)
FP(假阳性)
TP+FP
阴性(T-)
FN(假阴性)
TN(真阴性)
FN+TN
合计
TP+FN
FP+TN
N
注:TP:真阳性,FP:假阳性,FN:假阴性,TN:真阴性
TP+FP:诊断试验阳性数,FN+TN:诊断试验阴性数
TP+FN:真实病例总人数,FP+TN:真实健康总人数
诊断性资料
具体数据录入格式:
author
Tse
Adler1
Hoh
Crowe
Avril
year
1992
1993
1993
1994
1996
tp
4
8
6
9
19
fp
0
0
0
0
1
fn
3
1
3
1
5
tn
3
10
5
10
26
14
17
13
22
20
1
17
65
44
91
19
131
40
5
18
128
… …
Inoue
Zornoza
Weir
Gil-Rendo
Kumar
Stadnik
Chung
Veronesi
2004
2004
2005
2006
2006
2006
2006
2006
21
90
5
120
16
4
25
38
2
2
3
2
2
0
0
5
汇总结果
对应代码: midas tp fp fn tn, es(x) res(all)
敏感度与特异度
对应代码: midas tp fp fn tn, es(x) table(dss)
敏感度森林图
对应代码: midas tp fp fn tn , es(x) id(author) year(year) for(dss)
特异度森林图
对应代码: midas tp fp fn tn , es(x) id(author) year(year) for(dss)
Deek漏斗图
对应代码: midas tp fp fn tn , pubb
SROC曲线
对应代码:midas tp fp fn tn , es(x) plot sroc2
HSROC曲线
对应代码:metandi tp fp fn tn, plot nob noh
图形编辑
湖北医药学院附属太和医院循证医学中心
Center for Evidence-Based Medicine and Clinical Research
Taihe Hospital, Hubei University of Medicine

similar documents