RESULTADOS XIUHCOATL - Cluster Híbrido de Supercómputo

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RESULTADOS DE LA OPERACIÓN DEL CLÚSTER
HÍBRIDO DE SUPERCÓMPUTO
“XIUHCOATL“
LANCAD
Nodo Cinvestav:
CLÚSTER HÍBRIDO DE SUPERCÓMPUTO “XIUHCOATL”
• El pasado 25 de enero del 2012 la Coordinación General
de Servicios de Tecnologías de la Información y
Comunicaciones (CGSTIC) del CINVESTAV a cargo del Dr.
Marino Gamboa Zúñiga, realizó el lanzamiento del Clúster
Xiuhcoatl.
• El nombre “XIUHCOATL” significa Serpiente de Fuego y su
característica de ser Híbrido se debe a que incorpora tres
diferentes tecnologías de procesamiento, las cuales son:
– Tecnología de CPU INTEL Xeon X5675 (six-core).
– Tecnología de CPU AMD Opteron 6274 (16-core).
– Tecnología de GPGPU NVIDA Fermi (448-cudacores).
LANCAD
Clúster XIUHCOATL:“Serpiente de Fuego”
LANCAD
Nodos Robustos.
NODO
ROBUSTO
CINVESTAV
CLÚSTER
Xiuhcoatl
TECNOLOGÍA
HIBRIDA
CORES CPU
CUDA CORES
•3480 (CPU)
2304 (AMD)
1056 (INTEL)
•8960 (GPGPU-FERMI)
[20 Tarjetas]
PERFORMANCE
REAL (CPU)
24.97 TF
PERFORMANCE TEORICO
AMD (20.28 TF)
INTEL (12.93 TF)
GPU (10.3 TF)
Total 43.50TF
UAM
Aitzaloa
INTEL
2160 CPU
18.49 TF
25.44 TF
UNAM
Kanbalam
AMD
1368 CPU
5.09 TF
7.07 TF
1 TERAFLOP = 1012 OPERACIÓNes de punto flotante por segundo
Cada institución aporta 1000 cores de procesamiento sobre una red de fibra óptica de 10Gb/s de mas de 100km de longitud.
LANCAD
Nodo Cinvestav: Misión
Ofrecer y desarrollar servicios de cómputo de
alto desempeño a las comunidades de usuarios
de Supercómputo del CINVESTAV, UNAM, UAM
y en general al sector académico, empresarial
y gobierno, con el fin de impulsar el desarrollo
científico, la formación de recursos humanos
especializados en cómputo de alto desempeño
así como el desarrollo tecnológico para realizar
proyectos de alto impacto social y económico.
LANCAD
Nodo Cinvestav: Capacidad de cómputo
LANCAD
Nodo Cinvestav: Distribución
LFS
LFS
LFS
(OSS)
(OSS)
(MDS/OSS)
ABREVIATURA
N.C.G
SIGNIFICADO
N.M. N.L.
SW
InfiniBand
N.C.A.
N.C.A.
ABREVIATURA
N.C.I.
N.C.I.
N.C.I.
SIGNIFICADO
N.C.I.
Nodo de Computo INTEL
N.C.A
Nodo de Computo AMD
N.C.G
Nodo de Computo GPGPU
LFS
Lustre File System (Intel)
N.M.
Nodo Maestro (Intel)
OSS
Object Storage Server (Intel)
N.L.
Nodo de Login (Intel)
MDS
Meta Data Server (Intel)
LANCAD
Nodo Cinvestav: Tecnologías
GNU (gcc, fortran)
COMPILADORES
Intel Clúster Studio XE 2012
Open64 ACML (AMD)
CUDA SDK 4.1.
SISTEMA OPERATIVO
Linux x86_64 CentOS ver. 6.2.
HARDWARE
CPU
3480 Cores
*AMD
GPGPU
10 servidores INTEL
• 120 Cores.
• 20 Tarjetas NVIDIA
(Fermi 2070/2075)
*INTEL
(Xeon® Processor X5675)
(1056)
Capacidad de crecimiento
20 Tarjetas más.
SISTEMA DE
ALMACENAMIENTO
Una red Giga bit Ethernet
Dos sistemas
(Administración shell).
44TB y 22TB
(Usables)
Una red Giga bit Ethernet
(Interlagos 6274)
(2304)
INTERCOMUNICACION
(Administración de
Escritorio remoto).
Lustre File System
• Discos duros de
600GB, tecnología
SAS 2.0 de 15000
RPM en RAID 6.
Una Red InfiniBand 40Gb/s
(Full-non-Blocking)
Capacidad de
crecimiento para
120TB.
LANCAD
Nodo Cinvestav: Numeralia
No. De
Tipo de Tecnología de
Servidores Servidor Procesamiento
88
9
T
O
T
A
L
E
S
N.C.
CPU
INTEL
N.C.G.
CPU/GPU
*4 GPU INTEL/NVIDIA
Tarjetas
GPUs
#Cores
CPU
Memória
Cuda-Cores
RAM
GPU
(GB)
STORAGE
Local
STORAGE
Lustre
(GB)
(TB)
0
1056
0
2112
22000
36
108
*16128
432
4650
1
N.V.
CPU/GPU
INTEL /AMD
4
12
0
48
1200
72
N.C.
CPU
AMD
0
2304
0
4608
18000
170
36
3480 *16128 7200
65
Rmax
Consumo
eléctrico
estimado
(TF)
(KW)
24.97
70
Performance
Comunicaciones
(Gb/s)
1
1
Peso
Total
(Ton)
40
Ethernet Ethernet InfiniBand
(USABLES) (admón.) (admón.)
QDR
Escritorio
Remoto
4.5
45350
*=Capacidad Máxima Soportada.
N.C. = Nodos de Cómputo.
N.C.G = Nodos de Cómputo GPU.
N.V. = Nodo de Visualización.
LANCAD
Nodo Cinvestav: Servicios
ACADEMICO
•
•
•
•
•
Cómputo en Paralelo
Administración
Seguridad
Soporte
Capacitación en
Supercómputo
GUBERNAMENTAL
• Hospedaje de
Aplicaciones.
• Almacenamiento de
Datos.
• Desarrollo de
Aplicaciones
• Capacitación Virtual.
• Cloud.
EMPRESARIAL
• Renta de Servidores
• Desarrollo de
Aplicaciones
• Capacitación Virtual.
• Cloud.
RESULTADOS DE LA OPERACIÓN DEL CLÚSTER
HÍBRIDO DE SUPERCÓMPUTO
“XIUHCOATL“
PRIMERA CONVOCATORIA
LANCAD
Nodo Cinvestav: Primera Convocatoria
REQUISITOS PARA SOLICITUD DE RECURSOS
•
•
•
•
Ser investigador del Cinvestav.
Tener un proyecto que requiera de Supercómputo.
Se da preferencia a proyectos donde se involucren alumnos del Cinvestav.
Mandar Formato y Anexos firmados con los datos solicitados a: [email protected]
FORMATOS
ANEXOS
•Datos del solicitante
•Requerimientos de procesamiento
Horas de CPU.
Horas de GPU.
Número de JOBS.
•Requerimientos de hardware
Ram.
Espacio en home.
Espacio en scratch.
•Requerimientos de software.
ANEXO A: DESCRIPCION DEL PROYECTO
•Nombre del proyecto
•Objetivos
•Resumen del proyecto
•Lista de participantes:
Otros investigadores
Estudiantes
Auxiliares
Etc.
•Plataformas y recursos utilizadas anteriormente para correr la aplicación
•Beneficios esperados:
Publicaciones
Participaciones en congresos
Formación de recursos humanos
Otros: patentes, etc.
ANEXO B: EXPERIENCIA DEL SOLICITANTE
•El solicitante deberá anexar su Currículum Vitae en el que al menos incluya:
Descripción breve de su línea de trabajo
Producción académica
Experiencia en el uso de equipos de supercómputo.
LANCAD
Nodo Cinvestav: Primera Convocatoria
DICTAMENES
El día 12 de marzo se dio a conocer a los solicitantes el
dictamen emitido por el Comité Multidisciplinario de
Supercómputo de la CGSTIC.
CUENTAS/SUBCUENTAS CREADAS
• 44
-23 RECIBIDAS
-22 ACEPTADAS
SOLICTUDES PROVENIENTES DE 5 UNIDADES
• ZACATENCO
• MERIDA
• MONTERREY
• IRAPUATO
• TAMAULIPAS
(13)
(5)
(1)
(1)
(2)
HORAS TOTALES USADAS
• CPU
• 1,419,248
• 982,855
• GPU
• 10,549
(AMD)
(INTEL)
(FERMI)
SOLICITUDES POR DEPARTAENTOS
• FISICA -----------------------------------------
• QUIMICA -------------------------------------
• GENETICA Y BIOLOGIA MOLECULAR -
• MATEMATICAS ----------------------------
• LANGEBIO ----------------------------------
• LTI. ---------------------------------------------
• INGENIERIA ELECTRICA -----------------
(11)
(4)
(2)
(1)
(1)
(2)
(1)
HORAS TOTALES APROBADAS
• 3,060,000
• 13,910,400
(APROBADAS en CPU)
(APROBADAS en GPU)
LANCAD
Nodo Cinvestav: Primera Convocatoria (Proyectos)
INVESTIGADOR
DEPARTAMENTO
UNIDAD
ALBERTO MARCIAL VELA AMIEVA
QUIMICA
ZACATENCO
ANDREAS KÖSTER
PATRIZIA CLAMINICI
QUIMICA
QUIMICA
ZACATENCO
ZACATENCO
LILIANA QUINTANAR VERA
QUIMICA
ZACATENCO
FELIÚ DAVINO SAGOLS TRONCOSO
MATEMATICAS
ZACATENCO
GABRIEL GUARNEROS PEÑA
GENETICA Y BIOLOGIA MOLECULAR
ZACATENCO
JAIME GARCIA MENA
GENETICA Y BIOLOGIA MOLECULAR
ZACATENCO
LANGEBIO
NOMBRE DEL PROYECTO
ESTRUCTURA ELECTRÓNICA Y MOLECULAR DE SISTEMAS DE INTERÉS BIOLÓGICO Y DESARROLLO, IMPLEMENTACIÓN
Y VALIDACIÓN DE FUNCIONALES DE INTERCAMBIO-CORRELACIÓN.
DEVELOPMENT OF THE LCGTO-DFT CODE DEMON2K
MOLECULAR DYNAMIC SIMULATION OF COMPLEX SYSTEMS
ESTUDIO DE LA QUÍMICA REDOX DE LOS COMPLEJOS DE COBRE CON EL FRAGMENTO 106-‐115 DE LA PROTEÍNA
PRION HUMANA
CONSTRUCCIÓN DE DISEÑOS COMBINATORIOS, EVALUACIÓN DEL POLINOMIO TUTTE Y EL PROBLEMA DEL
CUADRADO INSCRITO.
GENÓMICA ESTRUCTURAL DE BACTERIÓFAGOS DE PSEUDOMONAS
LABORATORIO DE REFERENCIA Y APOYO PARA LA CARACTERIZACIÓN DE GENOMAS, TRANSCRIPTOMAS Y
MICROBIOMAS.
ENSAMBLADO Y ANÁLISIS DE GENOMAS EUCARIOTES Y PROCARIOTES ANTIGUOS Y CONTEMPORÁNEOS
RAFAEL MONTIEL DUARTE
LANGEBIO
JOSE TORRES JIMENEZ
LAB. TECNOLOGIAS DE LA INFORMACION
TAMAULIPAS CÁLCULO DE COVERING ARRAYS
ARTURO DIAZ PEREZ
LAB. TECNOLOGIAS DE LA INFORMACION
TAMAULIPAS
ESTRATEGIAS DE CÓMPUTO PARALELO EN MULTI/MANY-CORES PARA EL PROCESAMIENTO EFICIENTE DE REDES
COMPLEJAS.
FELIPE ALEJANDRO CRUZ PEREZ
INGENIERIA ELECTRICA
ZACATENCO
ANÁLISIS DE ESTRATEGIAS DE MANEJO DE RECURSOS ENSISTEMAS CON TRÁFICO DE VOIP
TONATIUH MATOS
FISICA
ZACATENCO
OBJETOS COMPACTOS Y MATERIA OBSCURA
JESÚS CARLOS RUIZ SUAREZ
FISICA
MONTERREY
SIMULACIÓN DE DINÁMICA MOLECULAR DE UNA MEMBRANA CELULAR MODELO EN PRESENCIA DE FÁRMACOS
POLARES Y NO POLARES EN DIVERSAS CONDICIONES FISIOLÓGICAS.
CRISTIAN FERNANDO MOUKARZEL
FISICA
MÉRIDA
DISCOS GRANULARES SUAVEMENTE VIBRADOS
CRISTIAN FERNANDO MOUKARZEL
FISICA
MÉRIDA
DINÁMICA DE SISTEMAS ECONÓMICOS INTERACTUANTES
RITO DANIEL OLGUIN MELO
FISICA
ZACATENCO
JAIME SANTOYO SALAZAR
FISICA
ZACATENCO
GABRIEL GUILLERMO PEREZ ANGEL
FISICA
MÉRIDA
SIMULACIÓN COMPUTACIONAL DE FUERZAS DE VACIAMIENTO ENTRÓPICO EN MEZCLAS COLOIDALES.
MARÍA CRISTINA VARGAS GONZALEZ
FISICA
MÉRIDA
PARAMETRIZACIÓN DE UN CAMPO DE FUERZAS PARA EL ANTIFÚNGICO ANFOTERICINA B POR MÉTODOS ABINITIO
MARÍA CRISTINA VARGAS GONZALEZ
FISICA
MÉRIDA
RAFAEL BAQUERO PARRA
FISICA
ZACATENCO
MAURICIO DEMETRIO CARBAJAL TINOCO
FISICA
ZACATENCO
ESTUDIO DE LAS PROPIEDADES ÓPTICAS, ESTRUCTURALES Y ELECTRÓNICAS DE LOS COMPUESTOS
SEMICONDUCTORES III-VI
ESTUDIO DE PROPIEDADES GEOMÉTRICAS, ENERGÉTICAS Y MAGNÉTICAS DE NANOPARTÍCULAS METÁLICAS
UTILIZADAS PARA EL TRATAMIENTO DE CÁNCER
SELECTIVIDAD
IÓNICA
DE
NANOPOROS
Y CANALES EN MEMBRANAS BIOLÓGICAS
ESTUDIO DE PROPIEDADES ESTRUCTURALES, ELECTRÓNICAS Y MAGNÉTICAS EN COMPUESTOS, SUPERFICIES E
INTERFACES DE ESTRUCTURAS METÁLICAS, SEMICONDUCTORAS Y SUPERCONDUCTORAS.
ESTUDIO DE MATERIALES BIOLÓGICOS Y POLIMÉRICOS POR MEDIO DE SIMULACIONES NUMÉRICAS
LANCAD
Nodo Cinvestav: Primera Convocatoria (USO)
USO DE GPU POR DEPARTAMENTO
LABORATORIO DE TECNLOGIAS
DE INFORMACION
QUIMICA
0%
2%
USO DE CPU POR DEPARTAMENTO
LABORATORIO DE TECNLOGIAS DE
INFORMACION
QUIMICA
FISICA
FISICA
MATEMATICA
MATEMATICA
INGENIERIA ELECTRICA
28%
40%
INGENIERIA ELECTRICA
98%
32%
LANGEBIO
LANGEBIO
GENETICA Y BIOLOGIA
MOLECULAR
GENETICA Y BIOLOGIA
MOLECULAR
USO DE GPU POR UNIDAD
2%
0%
USO DE CPU POR UNIDAD
0%
CIUDAD VICTORIA
CIUDAD VICTORIA
30%
LANGEBIO
MERIDA
98%
MONTERREY
LANGEBIO
61%
MERIDA
8%
MONTERREY
0%
ZACATENCO
1%
ZACATENCO
LANCAD
Nodo Cinvestav: SISTEMA DE ALMACENAMIENTO LUSTRE
USO DEL HOME
LIBRE
96%
USO DEL SCRATCH
USADO
4%
LIBRE
4%
81%
19%
USADO
19%
LANCAD
Nodo Cinvestav: MUESTRA REPRESENTATIVA DE USO DE CPU.
USO CPU XIUHCOATL (SEM14-SEM21)
1600
1400
1200
1000
800
600
400
200
0
14
15
16
17
18
19
20
21
RESULTADOS DE LA OPERACIÓN DEL CLÚSTER
HÍBRIDO DE SUPERCÓMPUTO
“XIUHCOATL“
SEGUNDA CONVOCATORIA
LANCAD
Nodo Cinvestav: Segunda Convocatoria
REQUISITOS PARA SOLICITUD DE RECURSOS
•
Requisitos adicionales a la primera convocatoria:
FORMATOS
•Datos de hasta dos cuentas adicionales
•Requerimientos de procesamiento para todo el
proyecto
Se agregó el modo de calcular el tiempo
solicitado.
LANCAD
Nodo Cinvestav: Segunda Convocatoria
LANZAMIENTO
DE LA 2da
CONVOCATORIA
EN XIUHCOATL
SOLICITUDES/PROYECTOS
-27 RECIBIDAS
-27 ACEPTADAS
El día 5 de Junio.
SOLICTUDES PROVENIENTES DE 4
UNIDADES
• ZACATENCO
• MERIDA
• TAMAULIPAS
• IRAPUATO
SOLICTUDES POR DEPARTAMENTOS
DICTAMEN
• FISICA ---------------------------------------------- (16)
• QUIMICA ------------------------------------------ (4)
• L.T.I. ------------------------------------------------ (2)
• GENETICA Y BIOLOGIA MOLECULAR ------ (1)
• LANGEBIO --------------------------------------- (1)
• LABORATORIO DE GEOMICA EVOLUTIVA - (1)
• FISIOLOGIA ,BIOFISICA Y NEUROCIENCIAS (1)
• CGSTIC -------------------------------------------- (1)
• El 16 de Julio
se dio a
conocer a los
solicitantes, el
resultado del
dictamen.
(12)
(11)
(2)
(2)
CUENTAS/SUBCUENTAS
CREADAS
• 35
HORAS TOTALES
5,200,000.00 (APROBADAS)
LANCAD
Nodo Cinvestav: Segunda Convocatoria (Proyectos)
INVESTIGADOR
DEPARTAMENTO
UNIDAD
RAFAEL BAQUERO PARRA
FISICA
ZACATENCO
PATRIZIA CALAMINICI
CASTRO HERNANDEZ
ROMERO DE COSS GÓMEZ
QUIMICA
FISICA
FISICA APLICADA
ROMERO DE COSS GÓMEZ
FISICA APLICADA
ROMERO DE COSS GÓMEZ
MAURICIO DEMETRIO CARBAJAL
TINOCO
FISICA APLICADA
LUIS JOSÉ DELAYE ARREDONDO
ARTURO DÍAZ PÉREZ
ANGELINA FLORES PARRA
GABRIEL GUARNEROS PEÑA
GERARDO HERRERA CORRAL
MARIANO GAMBOA ZUÑIGA
TONATIUH MATOS
FISICA
FISICA
FISICA
FISICA MERIDA
FISICA MERIDA
LUCIEN PETROVA VELEVA
FISICA MERIDA
GEONEL RODRIGUEZ GATTORNO
FISICA MERIDA
PABLO RUDOMIN
JOSE TORRES JIMENEZ
MAURICIO CARRILLO TRIPP
MARIA CRISTINA VARGAS
MARIA CRISTINA VARGAS
MARIA CRISTINA VARGAS
ALBERTO VELA AMIEVA
ESTUDIO DE PROPIEDADES ESTRUCTURALES, ELECTRÓNICAS Y MAGNÉTICAS EN COMPUESTOS, SUPERFICIALES E INTERFACES
DE ESTRUCTURAS METÁLICAS, SEMICONDUCTORAS Y SUPERCONDUCTORAS.
ZACATENCO GEOMETRY OPTIMIZATION AND PROPERTY CALCULATIONS OF COMPLEX SYSTEMS.
ZACATENCO NANOESTRUCTURAS Y SUS PROPIEDADES FISICAS EN PROCESOS AMBIENTALES.
MERIDA ESTUDIO DE PRIMEROS PRINCIPIOS DEL MAGNETISMO DE BORDE Y DE VACANCIAS EN NANOFLAKES DE GRAFENO.
ESTUDIO DE PRIMEROS PRINCIPIOS DE SOBRE PROPIEDADES ELECTRÓNICAS Y ÓPTICAS DE NANOESTRUCTURAS DE GRAFENO Y
MERIDA
NITRURO DE BORO.
MERIDA ESTRUCTURA ELECTRÓNICA DE LA TRICAPA BN/GRAFENO/BN BAJO PRESIÓN.
ZACATENCO ESTUDIO DE MATERIALES BIOLÓGICOS Y POLIMÉRICOS POR MEDIO DE SIMULACIONES NUMÉRICAS.
LABORATORIO DE GENÓMICA
DISEÑO E IMPLEMENTACIÓN DE UN MÉTODO PARA ALINEAMIENTO MÚLTIPLE DE SECUENCIAS GENÉTICAS A TRAVÉS DEL USO
TAMAULIPAS
EVOLUTIVA
DE TÉCNICAS DE PROGRAMACIÓN PARALELA, MÉTODOS HEURÍSTICOS Y PROGRAMACIÓN DINAMICA.
L..T.I
TAMAULIPAS ESTRATEGIAS DE CÓMPUTO PARALELO EN MULTI/MANY-CORES PARA EL PROCESAMIENTO EFICIENTE DE REDES COMPLEJAS
ESTUDIO TEÓRICO DE LA NATURALEZA DE ENLACES DÉBILES EN MOLÉCULAS DE INTERÉS BIOLÓGICO Y COMPLEJOS METÁLICOS
QUIMICA
ZACATENCO
DEL GRUPO REPRESENTATIVO.
GENÉTICA Y BIOLOGÍA
ZACATENCO GENÓMICA ESTRUCTURAL DE BACTERIÓFAGOS DE PSEUDOMONAS AERUGINOSA.
MOLECULAR
ZACATENCO RECONOCIMIENTO Y CLASIFICACIÓN DE MICRO CALCIFICACIONES, EN MAMOGRAFÍAS MEDIANTE TÉCNICAS DE RP Y
FISICA
PROCESAMIENTO DIGITAL DE IMÁGENES.
CGSTIC
ZACATENCO COMPUTO DE ALTO DESEMPEÑO Y CALCULO DE ESTRUCTURA ELECTRONICA DE NANOTUBOS DE CARBONO
GABRIEL MERINO
CRISTIAN MOUKARZEL
CRISTIAN MOUKARZEL
LILIANA QUINTANAR VERA
NOMBRE DEL PROYECTO
QUIMICA
NEUROFISIOLOGIA
NEOROCOMPUTACION
L.T.I.
LANGEBIO
FISICA MERIDA
FISICA MERIDA
FISICA MERIDA
QUIMICA
ZACATENCO COSMOLOGÍA Y ASTROFISICA RELATIVISTA: OBJETOS COMPACTOS Y MATERIA OBSCURA_2.
MERIDA
MERIDA
MERIDA
AROMATICIDAD Y EL DISEÑO DE NUEVOS CÚMULOS METÁLICOS.
DINAMICA DE SISTEMAS ECONOMICOS INTERACTUANTES.
DISCOS GRANULARES SUAVEMENTE VIBRADOS.
ASPECTOS FISICOQUIMICOS DE PROTECCION DE METALES CON AZOLES COMO INHIBIDORES VOLATILES DE CORROSION MERIDA
SILUACION MOLECULAR COMPUTACIONAL.
MERIDA CATALIZADORES PARA GENERACION DE HIDROGENO POR FOSILES DE AGUA.
ESTUDIO DE LA INTERACCION DE COBRE CON PROTEINAS AMILOIDOGENICAS ASOCIADAS A ENFERMEDADES
ZACATENCO
NEURODEGERATIVAS.
ZACATENCO TALLER MULTIDISCIPLARION EN EL CINVESTAV No. ORD.4/2011 Conacyt.
TAMAULIPAS CALCULO DE COVERINGS ARRAYS.
IRAPUATO ANALISIS MOLECULAR DE LOS MECANISMOS DE ACCION DE ANTIBIOTICOS
MERIDA TIEMPOS DE CRISTALIZACION Y POLIDISPERSIDAD EN UN FLUIDO DE ESFERAS DURAS.
MERIDA PARAMETRIZACION DE UN CAMPO DE FUERZAS PARA EL ANTIFUNGICO ANFOTERICINA B POR METODOS AB-INITIO.
MERIDA SELECTIVIDAD IONICA DE NANOPOROS Y CANALES EN MEMBRANAS BIOLOGICAS.
ESTRUCTURA ELECTRONICA Y MOLECULAR DE SISTEMAS DE INTERES BIOLOGICO Y DESARROLLO, IMPLEMENTACION Y
ZACATENCO
LANCAD
Nodo Cinvestav: Segunda Convocatoria (USO)
USO DE CPU POR UNIDAD
USO DE CPU POR DEPARTAMENTO
11%
0%
TAMAULIPAS
7%
LABORATORIO DE
TECNLOGIAS DE
INFORMACION
FISICA
34%
30%
59%
ZACATENCO
59%
GENETICA y BIOLOGIA
MOLECULAR
MERIDA
QUIMICA
LANCAD
Nodo Cinvestav: MUESTRA REPRESENTATIVA DE USO DE CPU.
USO DE CPU EN XIUHCOATL SEM (32 -34)
2000
1800
1600
1400
1200
1000
800
600
400
200
17/08/2012
16/08/2012
15/08/2012
14/08/2012
13/08/2012
12/08/2012
11/08/2012
10/08/2012
09/08/2012
08/08/2012
0
LANCAD
Nodo Cinvestav: SISTEMA DE ALMACENAMIENTO LUSTRE
USO DEL HOME
LIBRE
95%
USO DEL SCRATCH
USADO
5%
LIBRE
5%
80%
20%
USADO
20%
RESULTADOS DE LA OPERACIÓN DEL CLÚSTER
HÍBRIDO DE SUPERCÓMPUTO
“XIUHCOATL“
RESUMEN DE LAS CONVOCATORIAS 1 Y 2
LANCAD
Nodo Cinvestav: Resumen de Convocatorias
SOLICITUDES/PROYECTOS
-49
(APROBADAS)
-50
(RECIBIDAS)
SOLICTUDES PROVENIENTES DE 5 UNIDADES
• ZACATENCO
• MERIDA
• TAMAULIPAS
• IRAPUATO
• MONTERREY
(25)
(16)
(4)
(3)
(1)
SOLICTUDES POR DEPARTAMENTOS
• FISICA --------------------------------------------- (27)
• QUIMICA ----------------------------------------- (8)
• L.T.I. ----------------------------------------------- (4)
• GENETICA Y BIOLOGIA MOLECULAR ------ (3)
• LANGEBIO --------------------------------------- (2)
• LABORATORIO DE GEOMICA EVOLUTIVA - (1)
• FISIOLOGIA ,BIOFISICA Y NEUROCIENCIAS (1)
• CGSTIC -------------------------------------------- (1)
• MATEMATICAS --------------------------------- (1)
• INGENIERIA ELECTRICA ------------------------ (1)
DICTAMEN
• El 16 de Julio se
dio a conocer a
los solicitantes ,
el resultado del
dictamen.
CUENTAS/SUBCUENTAS
CREADAS
• 79
HORAS TOTALES
8,260,000 (APROBADAS)
2, 934,709 (UTILIZADAS AL 16 DE AGOSTO)
LANCAD
Nodo Cinvestav: (USO TOTAL DE CPU Y GPU)
USO TOTAL DE GPU AL DIA 16 de
AGOSTO DE 2012 POR DEPARTAMENTO
0%2%0%
0%
0%
USO TOTAL DE CPU AL DIA 16 de AGOSTO
DE 2012 POR DEPARTAMENTO
LABORATORIO DE TECNLOGIAS
DE INFORMACION
QUIMICA
0%
29%
FISICA
0%
LABORATORIO DE TECNLOGIAS DE
INFORMACION
QUIMICA
0% 0%
FISICA
43%
MATEMATICA
MATEMATICA
98%
INGENIERIA ELECTRICA
LANGEBIO
LANGEBIO
GENETICA Y BIOLOGIA
MOLECULAR
GENETICA Y BIOLOGIA
MOLECULAR
USO TOTAL DE GPU AL DIA 16 DE
AGOSTO DE 2012 POR UNIDAD
2% 0%0%
INGENIERIA ELECTRICA
28%
USO TOTAL DE CPU AL DIA 16 DE AGOSTO
DE 2012 POR UNIDAD
36%
TAMAULIPAS
IRAPUATO
TAMAULIPAS
IRAPUATO
55%
MERIDA
98%
MERIDA
0%
MONTERREY
ZACATENCO
1%
8%
MONTERREY
ZACATENCO
LANCAD
Nodo Cinvestav: Aplicaciones Instaladas
APLICACIONES
abinit
bwa
clisp
clustalw-2.0.10
deMon
Espresso
g03
Gadget-2
Games
Gromacs
I-TASSER
igraph
MAXIMA
Muscle-3.7
NAMD_2.8
NAMD_2.8-GPU
Newbler
nwchem
OACTAVE
orca_x86_64_exe_r2360
Parallel-TCoffee
Polybori
TCOFFE
velvet
Wien2k
Yambo
Zeusmp
7 APLICACIONES PROPIAS
ADF
Cactus-Codes
SIESTA
Terachem
VASP
(En proceso)
(En Proceso)
(En proceso)
(En proceso)
(En proceso)
LABORATORIO NACIONAL DE COMPUTO DE ALTO
DESEMPEÑO (LANCAD)
“NODO CINVESTAV”
CONVOCATORIA EXTERNA
LANCAD
Nodo Cinvestav: Primera Convocatoria para
instituciones externas.
REQUISITOS PARA SOLICITUD DE RECURSOS
•
Requisitos similares a la segunda convocatoria
+
CONVENIO
•Se firmará un convenio que efectuarán las dos
partes, el CINVESTAV y la institución interesada
en usar tiempo de CPU.
http://clusterhibrido.cinvestav.mx/
LABORATORIO NACIONAL DE COMPUTO DE ALTO
DESEMPEÑO
(LANCAD)
SEGUNDA PARTE
LANCAD
Objetivo General
La consolidación y mantenimiento al día, a través del tiempo, de un
Laboratorio Nacional de Cómputo de Alto Desempeño, que permita resolver
en primera instancia los problemas científicos más demandantes mediante
una GRID de capacidades excepcionales en la zona metropolitana de la
Ciudad de México conformada por las tres instituciones académicas de mayor
importancia en el cómputo científico de alto desempeño.
LANCAD
La red de FO dentro del Metro.
DISTANCIAS Y EMPALMES
• DISTANCIAS SIN INTEGRAR LA ULTIMA MILLA
»
DISTANCIA
• UNAM – UAM-I
34,325m
• UNAM – CINVESTAV 27,544m
• CINVESTAV – UAM-I 31,588m
FUSION
MECANICO
21
20
20
2
1
2
• DISTANCIAS INTEGRANDO LA ULTIMA MILLA
»
DISTANCIA
• UNAM – UAM-I
39,325m
• UNAM – CINVESTAV 32,544m
• CINVESTAV – UAM-I 36,588m
Rack con empalme por fusión
Rack con empalme mecánico
FUSION
21
20
20
•
Fusión
Empalme por fusión
•
Mecánico
Empalme mecánico en patch panel
MECANICO
2
1
2
Longitud total de la red de fibra óptica 108.4 km
LANCAD
Segunda Parte: Desarrollo Científico
El Cómputo de Alto Desempeño es indispensable, en la actualidad, para la
realización de proyectos científicos y tecnológicos en temas relacionados con,
entre otros:
Ingeniería molecular
Biomedicina
Imagenología médica
Materiales
Astronomía
Robótica
Modelación matemática
Energía
Diseño y automatización
de procesos
Contaminación ambiental
Nanotecnología
Aeronáutica
Estudios climáticos
Genómica
Sísmica
LANCAD
Segunda Parte: Desarrollo Científico
Cadena de valor
Educación
superior
Investigación
científica
Desarrollo
tecnológico
Innovación
Una plataforma competitiva de Cómputo de Alto
Desempeño posibilita el desarrollo de esta cadena de valor.
Una plataforma no competitiva de Cómputo de Alto
Desempeño, compromete, fuertemente, las posibilidades de
desarrollo de esta cadena de valor.
LANCAD
Segunda parte: evolución del TOP500
LANCAD
Segunda parte: evolución del TOP500
LANCAD
Segunda parte: Escenarios de inversión anual
XIUHCOATL PROYECCION DE
CRECIMIENTO
LANCAD
Nodo Cinvestav: Proyección de Crecimiento
OBJETIVO:
• Lograr alcanzar un performance real de al menos 90TF,
incrementando la capacidad:
– De procesamiento CPU.
– Del número de tarjetas GPGPU.
– De puertos Infiniband QDR/FDR.
• Incrementar la capacidad del Sistema de Almacenamiento
Lustre.
• Incrementar la capacidad de memoria RAM en algunos
servidores.
LANCAD
Nodo Cinvestav: Proyección de Crecimiento
EL
PERFORMANCE
ACTUAL DE
XIUHCOATL ES
DE 24.74 TF
REALES
SE REQUIERE
AUMENTAR LA
CAPACIDAD DE
PROCESAMIEN
TO PARA
LOGRAR
ALMENOS 90
TF REALES
ESTE CRECIMIENTO
SE PUEDE ALCANZAR
USANDO:
-TECNOLOGÍA AMD.
-TECNOLOGÍA NTEL.
La nueva tecnología de
procesadores Intel, es capaz de
realizar hasta 8 OPERACIÓNes de
punto flotante por ciclo de reloj.
UN SERVIDOR EN LA
ULTIMA TECNOLOGÍA
DE CPU INTEL CON UN
TOTAL DE 16 CORES A
2.6GHz PROVEE UN
PERFORMANCE:
UN SERVIDOR EN LA
ULTIMA TECNOLOGÍA
DE AMD CON UN TOTAL
DE 16 CORES A 2.5GHz
PROVEE UN
PERFORMANCE:
-TEÓRICO DE 332.8
GFLOP/S .
-TEÓRICO DE 320
GFLOP/S.
-REAL DE 300 GFLOP/S.
-REAL DE 256 GFLOP/S.
La nueva tecnología de
procesadores AMD, es capaz de
realizar hasta 4 OPERACIÓNes de
punto flotante por ciclo de reloj.
LANCAD
Nodo Cinvestav: Proyección de Crecimiento
PASOS A REALIZAR PARA LA ACTUALIZACIÓN DE AL MENOS
90TF
Se requiere de
Se requiere de Para abatir la disipación
un nuevo SW
alrededor de de calor se requiere de
Definir la
Evaluar las
IB para
10 Racks de aproximadamente 90TR
tecnología con
modalidades
interconectar
footprint
extras.
la que se
que beneficien
con el actual e
adicional, para
Ó
realizará el
el consumo
incrementar el
el alojamiento
crecimiento.
energético.
(Una combinación con
número de
del nuevo
sistemas In-Row, etc.).
puertos.
equipo.
Instalar un
nuevo Centro
de Datos.
La arquitectura y diseño con que se proyectó el CLÚSTER Xiuhcoatl, permite incrementar el
número de puertos InfiniBand hasta en 1296 puertos (actualmente hay 324 puertos), y en
esta primera etapa de crecimiento, en términos de núcleos de procesamiento se podrá
crecer hasta más de una decena de Miles de núcleos con el mismo CLÚSTER.
Chi….. que
• La palabra chocolate viene del náhuatl:
Xocolatl( se debería pronunciar como
shocolatl, que es el sonido sh de la x )
• Xiuhcoatl, se pronuncia entonces
shiuhcoatl o de plano Chiuhcoatl!
RESULTADOS DE LA OPERACIÓN DEL CLÚSTER
HÍBRIDO DE SUPERCÓMPUTO
“XIUHCOATL“

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